Guna mewujudkan visi tersebut, Program Studi Magister Teknik Sipil menetapkan misi sebagai berikut:

1. Meningkatkan kualitas dan kuantitas pendidikan Magister Teknik Sipil guna menghasilkan lulusan yang mempunyai keunggulan kompetitif/ komparatif secara nasional maupun internasional dan mampu berkontribusi pada pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi bidang ke-teknik-sipil-an;
2. Meningkatkan kualitas dan kuantitas penelitian, publikasi serta kepemilikan Hak Atas Kekayaan Intelektual (HAKI) sebagai upaya pengembangan ilmu pengetahuan, teknologi ke-teknik-sipil-an dengan mengedepankan sumber daya dan kearifan lokal;
3. Meningkatkan kualitas dan kuantitas pengabdian kepada masyarakat sebagai upaya penerapan dan pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi ke-teknik-sipil-an tepat guna;
4. Meningkatkan kapabilitas, profesionalitas, akuntabilitas dan tata kelola serta kemandirian penyelenggaraan Program Studi;
5. Meningkatkan kerjasama/ kemitraan dengan institusi/ lembaga dalam dan luar negeri.